磷对大豆根系生长的促进作用有利于根瘤的形成。当土壤中磷的供应不足时，大豆根瘤虽然能侵入根中，但是不结瘤。钼肥是根瘤固氮必不可少的微量元素，土壤缺磷的情况下，单施钼肥反而使根瘤减少。磷对根瘤中氨基酸的合成以及根瘤中可溶性氮向植株其他部分转移，都有重要作用。所以种植大豆或其他豆科作物，施用磷肥增产效果特别显著。磷肥在土壤中移动性小，容易被吸附固定，因此磷肥应该与有机肥混合堆沤后，采用沟施、穴施等集中施用方法为好。每亩施用量过磷酸钙为15-25公斤，缺磷严重的土壤，用量可适当增加。大豆播种时间可用少量过磷酸钙拌种，以满足苗期生长和根瘤菌繁殖对磷的需要。大豆可用磷酸二氢钾进行叶面施肥，浓度为0.1-0.2%，在初花期和终花期各喷1次，每次用100克左右，也有一定增产效果。