水稻烂秧是种子、幼芽和幼苗在秧田期烂种、烂芽和死苗的总称，可分为生理性和传染性两大类。生理性烂种是指纯属不良环境条件所造成的病害，传染性烂秧则多指不良环境诱致腐霉菌、绵霉菌、镰刀菌、丝核菌等弱性寄生菌为害而引起的病害。大面积的烂芽和死苗多属于传染性病害。
防治水稻烂秧病，应采取以提高育秧技术、改善环境条件、增强稻苗抗病力为重点，适时进行药剂防治的综合方法。
1、提高秧田质量。秧田应选择肥力中等、避风向阳、排灌方便且地势较高的地方。
2、精选种谷。种谷要纯、净、健壮、成熟度高。浸种前晒种1-2天，降低种子含水量。
3、提高浸种催芽技术。浸种要浸透，催芽过程中要使水分、温度、氧气三者关系协调。
4、掌握播种质量。根据品种特性，确定播种适期、播种量和秧龄。
5、科学管水。芽期保持畦面湿润，不能过早上水，以保证扎根需氧和防止芽鞘徒长。
6、合理施肥。秧田施足基肥，追肥少量多次，应提高磷钾肥的比例。
7、药剂防治。①土壤消毒：绿亨一号用于旱育秧、水育秧和塑料软盘育秧土壤的消毒，是防治烂秧的最佳药剂之一。消毒的具体方法：首先将秧田平整好，播种后，每平方米用绿亨一号1-1.5克或绿亨一号0.5克加绿亨二号2-3克，与过筛的湿润细土10-20公斤充分掺匀，均匀撒于播种后的秧田或育秧盘上作盖土。②对老秧田或灌溉污水的秧田，宜在发病前或发病前期用绿亨二号对水800-1000倍喷雾，同时可兼治及预防水稻苗叶瘟、水稻纹枯病、水稻恶苗病的发生和流行。